Liga Pro Serie B
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Campeonato Ecuatoriano Serie B 1999
CampeónTécnico Universitario▲ Ascendió a Serie A
- Subcampeón
LDU Portoviejo▲ Ascendió a Serie A
Campeonato Ecuatoriano Serie B 1999 fue la edición número 7 del torneo. Técnico Universitario se consagró campeón por delante de LDU Portoviejo, su primer título en la competencia. El campeón defensor era Macará.
Tabla Final
| # | Equipo | PJ | G | E | P | GF | GC | Pts |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  Técnico Universitario | 28 | 18 | 9 | 1 | 68 | 29 | 63 |
| 2 |  LDU Portoviejo | 27 | 12 | 10 | 5 | 48 | 26 | 46 |
| 3 |  Universidad Católica | 28 | 9 | 7 | 12 | 30 | 32 | 34 |
| 4 |  Deportivo Quevedo | 27 | 6 | 15 | 6 | 34 | 32 | 33 |
| 5 |  Esmeraldas Petrolero | 27 | 7 | 11 | 9 | 29 | 37 | 32 |
| 6 | Santa Rita | 27 | 8 | 8 | 11 | 22 | 35 | 32 |
| 7 | Panamá | 28 | 5 | 10 | 13 | 37 | 52 | 25 |
| 8 | Deportivo Quinindé | 28 | 4 | 12 | 12 | 20 | 45 | 24 |
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